Référentiel en microbiologie des sols de Saône-et-Loire

Calculez les paramètres microbiologiques de référence pour votre sol !

Les valeurs de référence accessibles sont la biomasse moléculaire microbienne et la diversité taxonomique bactérienne que l'on s'attend à trouver dans un sol en fonction de ses caractéristiques physico-chimiques. Pour effectuer le calcul, vous devez disposer de la teneur en argile, en carbone organique, et en Phosphore Olsen, du rapport C/N, du pH et de la longitude (que vous pouvez déterminer sur geoportail > outils > afficher les coordonnées > Lambert II étendu en mètres).

Ce programme utilise le modèle developpé par Walid Horrigue selon la méthode détaillée dans : Walid Horrigue, Samuel Dequiedt, Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, Claudy Jolivet, Nicolas P. A. Saby, Dominique Arrouays, Antonio Bispo, Pierre-Alain Maron, et Lionel Ranjard. 2016. Predictive model of soil molecular microbial biomass. Ecological Indicators 64 (mai): 203-11. Les modèles utilisés sont valables pour les sols de prairies permanentes et de cultures assolées de Saône-et-Loire.

Plus d'informations disponibles sur la page web de l'étude.

Ce travail a été réalisé en partenariat avec l'UMR Agroécologie de l'INRA de Dijon et la plate-forme GenoSol, et avec le soutien financier du Conseil Départemental de Saône et Loire, du Conseil Régional de Bourgogne-Franche-Comté, de l'ADEME et du fond CASDAR. Merci à toutes les personnes qui ont contribué à sa réussite !

Application réalisée par Julien Halska - jhalska[ at ]sl.chambagri.fr

Entrez les valeurs de votre sol (les décimales doivent être indiquées par une virgule et non par un point).

Lecture des graphiques : les pointillés de droite correspondent à la valeur de référence pour votre sol. A proximité de cette valeur ou au dessus, l'abondance des microorganismes ou la diversité des bactéries est stimulée. Les pointillés de gauche correspondent à la valeur critique (70% de la valeur de référence), seuil au dessous duquel il y a des risques de perte de fonctions biologiques. Si vous avez renseigné une valeur mesurée, elle est représentée par une barre verticale (qui peut être confondue avec les pointillés si elle est égale à l'un des seuils). Le graphique n'est pas affiché en cas de résultat aberrant (négatif ou très élevé).

Votre biomasse moléculaire microbienne de référence en µg d'ADN / g de sol :

Ne pas tenir compte du [1]. Une valeur négative ou supérieure à 400 signifie que les paramètres de votre sol sont atypiques par rapport aux valeurs utilisées pour la construction du modèle (une valeur négative très proche de zéro peut être assimilée à zéro).

Votre diversité bactérienne de référence en nombre de taxons :

Ne pas tenir compte du [1]. Une valeur négative ou supérieure à 6000 signifie que les paramètres de votre sol sont atypiques par rapport aux valeurs utilisées pour la construction du modèle (une valeur négative très proche de zéro peut être assimilée à zéro).

L'application va produire et vous proposer de télécharger un fichier contenant vos données d'entrée et deux nouvelles colonnes appelées 'predbmm' pour la biomasse moléculaire microbienne de référence et 'preddivbact' pour la diversité bactérienne de référence

Conseils pour formater votre fichier de données :

Chaque ligne doit correspondre aux caractéristiques physico-chimiques d'un même prélèvement, en général une parcelle. Il doit y avoir une colonne par variable d'entrée nécessaire au modèle. Les noms des colonnes et les unités des variables doivent être exactement respectés, y compris les majuscules et minuscules :

* argile : teneur en argile en g/kg (comprise entre 25 et 750 g/kg)

* carbone : teneur en carbone organique en g/kg (comprise entre 4 et 70 g/kg)

* C_N : (compris entre 7 et 16)

* ph_eau : pH eau, sans unité (compris entre 4 et 9)

* P2O5 : avec des majuscules, teneur en phosphore olsen en g/kg (comprise entre 0,01 et 0,6 g/kg)

* x : (en minuscules) longitudes en mètres en format Lambert 2 étendu (comprise entre 705 000 et 834 000 mètres)

Les décimales doivent être indiquées par des virgules. Le séparateur doit être le point-virgule.

Vos résultats :

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